Слизистые гениталий женщин играют важную роль в поддержании нормальной функции урогенитальной системы. Будучи открытой системой, свободно сообщающейся с внешней средой, гениталии, тем не менее, являются преградой для агрессивной бактериальной инвазии из вне в слизистые влагалища, цервикального канала, матку, трубы и яичники.
Обеспечение барьерной функции осуществляется неспецифической и иммунологической резистентностью посредством выработанных в процессе фило- и онтогенеза систем. К таким защитным механизмам, прежде всего, следует отнести анатомо-физиологические особенности женских половых органов, в частности, четкое разграничение нижнего и верхнего отделов, что в значительной степени ограничивает возможность интраканаликулярного распространения инфекции. В первую очередь это достигается разобщением влагалища и внешней среды: физиологический гипертонус мышц промежности, суживающий вульварное кольцо, соприкосновение малых и больших половых губ — естественные затворы.
Неменьшее значение имеет и второй биологический барьер. Половые пути женщины представляют собой совокупность микроучастков различного типа, каждый из которых представляет собой среду обитания, или экологическую нишу, населенную несколькими видами микроорганизмов. Каждой экологической нише присуща своя, несколько отличная от других, популяция микроорганизмов. Хотя микроорганизмы хорошо адаптируются к изменяющимся условиям обитания, последние оказывают на них как количественное, так и качественное влияние. Многослойный плоский эпителий стенки влагалища вследствие общности происхождения с эндометрием (из эпителия мюллеровых нитей) является гормонально-зависимой тканью.
Система самоочищения влагалища функционирует благодаря циклическому влиянию эстрогенов в первую фазу цикла и прогестерона во вторую. Если под действием эстрогенов происходит рост многослойного плоского эпителия, синтез в нем гликогена, продукция слизистого секрета в шейке матки (слизистая «пробка»), то под влиянием прогестерона происходит десквамация и цитолиз многослойного плоского эпителия. Во время беременности гормональные изменения в эпителии влагалища и шейки матки связаны с прогрессирующим снижением величины pH влагалищного содержимого, что вызывает рост нормальной влагалищной флоры — лактобацилл, так как эстрогенная активность способствует увеличению количества клеток влагалищного эпителия и накоплению в них гликогена.
Гликоген является субстратом для метаболизма лактобацилл, ведущего к образованию молочной кислоты. Молочная кислота, поддерживает кислую реакцию влагалищного содержимого (pH 3,8-4,4), необходимую для роста лактобацилл и подавления «конкурентной» микрофлоры. Лактобациллы при этом являются фактором неспецифической защиты. У здоровых беременных женщин по сравнению с небеременными имеет место 10-кратное увеличение (!) выделения лактобактерий и снижение уровня колонизации бактериями шейки матки по мере увеличения срока беременности. Эти изменения приводят к тому, что ребенок рождается в среде, содержащей микроорганизмы с низкой вирулентностью, и контаминируют лактофлору, которая и для него становится основным фактором устойчивости к патогенной микрофлоре внешней среды.